如何優雅地獲得漂亮小分子蛋白條帶

做過 Western-Blot 的童鞋知道，分子量小于 30KDa 的蛋白分子不容易做。小分子蛋白虐我千百遍，我待小分子蛋白如初戀。抱怨是沒用的，想方設法解決問題才是正道。一次又一次的調整方案，一次又一次的徒勞無功。在此，總結了小分子蛋白之路經驗，供有需求的童鞋參考。

一、提蛋白的過程在 30 分鐘之內完成，提完蛋白立即加入上樣緩沖液煮沸（煮沸的時間長一點，一般 20 分鐘），準備好蛋白樣品后立即電泳。（小分子蛋白容易形成多聚體，這樣可以大大減少多聚體的形成）。

二、電泳時，電泳的時間要足夠長。習慣是先用 60-80V 電壓跑完濃縮膠，再以 100-120V 電壓跑分離膠，溴酚藍電泳至玻璃板底部。伯樂系列的電泳槽一般電泳 2 個小時左右，GE 以及百晶系列的電泳槽要電泳 4 到 5 個小時。電泳時要在冰水浴中進行。最好用 1mm 和 1.5mm 厚的膠（若用 0.75mm 厚的膠時要適當縮短轉膜時間）。

三、轉膜時，盡量用濕轉法（半干轉也可以，但是容易轉過）。轉膜緩沖液中，甲醇濃度要達到 20%。PVDF 膜，財大氣粗的土豪可以用 0.22 微米的膜。對于我們大多數窮人來說，0.45 微米的膜也是可以的。以下是摸索出來的轉膜時間（濕轉法，0.45 微米的膜），供大家參考。

四、一抗孵育因為多數小分子蛋白的表達量較少，所以我一般孵育至少 48 個小時，甚至孵育 72 個小時。以上方法適用于分子量在 20-30KDa 的蛋白。若蛋白分子量小于 15KDa，則不用 SDS-PAGE 凝 膠電泳（蛋白與 SDS 共遷移，影響分離度，得不到很好的分離效果），應該采用 Tris-Tricine 緩沖系統與 Tricine 分離膠。具體操作步驟見《精編分子生物學實驗室指南》338-340 頁（這本書每個實驗室必會備，若沒有，可以在孔夫子舊書市場上買一本）。

需要注意的是，Tricine 電泳時，蛋白樣品用 Tricine 樣品緩沖液處理，加樣前在 37-40℃沙浴中處理一個小時（不要煮沸！不要煮沸！不要煮沸！重要的事情說三遍）。內槽中加滿陰極緩沖液，外槽中加滿陽極緩沖液（千萬不要加反了。否則蛋白全部進入緩沖液！）。 

最后，祝做小分子蛋白的童鞋實驗之路順利，早日做出滿意的結果。